Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MyripQ8K3I4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms