Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Ssh3Q8K330 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms