Protein–RNA interactions for Protein: Q8K274

Fn3krp, Ketosamine-3-kinase, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fn3krpQ8K274 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fn3krpQ8K274 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fn3krpQ8K274 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms