Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrit1Q8K099 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrit1Q8K099 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lrit1Q8K099 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrit1Q8K099 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrit1Q8K099 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrit1Q8K099 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrit1Q8K099 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrit1Q8K099 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrit1Q8K099 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrit1Q8K099 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrit1Q8K099 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrit1Q8K099 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrit1Q8K099 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrit1Q8K099 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrit1Q8K099 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrit1Q8K099 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrit1Q8K099 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrit1Q8K099 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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