Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms