Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms