Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms