Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms