Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lancl3Q8CD19 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms