Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms