Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa5Q8C7G5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa5Q8C7G5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms