Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp47Q8BY87 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms