Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA0

Lrfn5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn5Q8BXA0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrfn5Q8BXA0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrfn5Q8BXA0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms