Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx1bQ8BX32 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slx1bQ8BX32 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slx1bQ8BX32 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms