Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ube3dQ8BX13 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ube3dQ8BX13 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms