Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ssc5dQ8BV57 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms