Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup54Q8BTS4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms