Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms