Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan12Q8BKT6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan12Q8BKT6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms