Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc9Q8BJN4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms