Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms