Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms