Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
U2af1l4Q8BGJ9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms