Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atg4bQ8BGE6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4bQ8BGE6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms