Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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