Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Pknox2Q8BG99 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms