Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdspl2Q8BG15 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdspl2Q8BG15 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms