Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.3Q85ZW6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms