Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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Atg4cQ811C2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Atg4cQ811C2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Atg4cQ811C2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Atg4cQ811C2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms