Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms