Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NfascQ810U3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms