Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrde2Q80XC6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms