Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ell3Q80VR2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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