Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms