Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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