Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrc2aQ7TSC1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms