Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms