Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkd1l2Q7TN88 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkd1l2Q7TN88 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkd1l2Q7TN88 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd1l2Q7TN88 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd1l2Q7TN88 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd1l2Q7TN88 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd1l2Q7TN88 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd1l2Q7TN88 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd1l2Q7TN88 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd1l2Q7TN88 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd1l2Q7TN88 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd1l2Q7TN88 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd1l2Q7TN88 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd1l2Q7TN88 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd1l2Q7TN88 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd1l2Q7TN88 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd1l2Q7TN88 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd1l2Q7TN88 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms