Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TwistnbQ78WZ7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms