Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Vma21Q78T54 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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