Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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