Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ino80Q6ZPV2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms