Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms