Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd300lfQ6SJQ7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms