Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300ld3Q6SJQ5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300ld3Q6SJQ5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms