Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms