Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab35Q6PHN9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab35Q6PHN9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab35Q6PHN9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab35Q6PHN9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab35Q6PHN9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab35Q6PHN9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms