Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms