Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms