Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SvoplQ6PDF3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms